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使用Ks方法进行全基因组复制事件研究 原理 全基因组复制（Whole Genome Duplication，WGD）是指在一次进化过程中整个基因组的复制。在植物的演化过程中，WGD是非常普遍的现象，它不仅影响着植物的基因组大小和结构，还对植物的形态、生态和适应性等方面产生了深远的影响。因此，对于植物WGD事件的研究具有重要的科学意义和实际应用价值。 Ks值是同源基因的替换率，通常被用来研究同源基因演化的速率。在全基因组复制事件发生后，同一个物种的基因组中同源基因的数量会翻倍，因此同源基因之间的Ks值峰值通常会向左移动。因此，Ks方法可以用来研究WGD事件的时间和方式等信息。 常用方法 在Ks分析中，同源基因序列被比对后计算其Ks值，通常使用剪枝法、最小二乘法或最大似然法等不同的计算方法。剪枝法是最常用的方法之一，它通过排除显然不合理的Ks值，从而提高计算的准确性和可靠性。 除了Ks分析，还有其他一些分子标记和生物信息学方法也可以用来研究WGD事件，如基于基因家族演化的分析方法、基于分子标记的时钟分析方法等。在具体研究中，不同的方法可以相互验证和印证，以提高分析结果的准确性和可靠性。 实 ...

视频链接：https://www.bilibili.com/video/BV1og4y1q7M4 Docker镜像讲解 镜像是什么 Docker镜像是一种轻量级、可执行的独立软件包，用来打包软件运行环境和基于运行环境开发的软件，它包含某个软件所需的所有内容，包括代码、库、环境变量、配置文件、运行时环境等。 所有的应用，直接打包成Docker镜像，然后通过镜像创建出容器，然后就可以直接跑起来。 如何得到镜像： 从远程仓库下载，比如docker hub、阿里云的镜像仓库等。 朋友拷贝给你。 自己制作一个镜像DockerFile。 通过对原有的镜像创建的容器进行一些修改（也可以不修改），然后通过Commit命令提交一个新的镜像。 UnionFS（联合文件系统） 联合文件系统（UnionFS）是一种分层、轻量级并且高性能的文件系统，它支持对文件系统的修改作为一次提交来一层层的叠加，同时可以将不同目录挂载到同一个虚拟文件系统下。联合文件系统是 Docker 镜像的基础。镜像可以通过分层来进行继承，基于基础镜像（没有父镜像），可以制作各种具体的应用镜像。 特 ...

视频链接：https://www.bilibili.com/video/BV1og4y1q7M4 概述 官网: https://docs.docker.com/ Docker Hub 网站: https://hub.docker.com/ 容器较为官方的解释 一句话概括容器：容器就是将软件打包成标准化单元，以用于开发、交付和部署。 容器镜像是轻量的、可执行的独立软件包 ，包含软件运行所需的所有内容：代码、运行时环境、系统工具、系统库和设置。 容器化软件适用于基于 Linux 和 Windows 的应用，在任何环境中都能够始终如一地运行。 容器赋予了软件独立性，使其免受外在环境差异（例如，开发和预演环境的差异）的影响，从而有助于减少团队间在相同基础设施上运行不同软件时的冲突。 容器较为通俗的解释 如果需要通俗地描述容器的话，我觉得容器就是一个存放东西的地方，就像书包可以装各种文具、衣柜可以放各种衣服、鞋架可以放各种鞋子一样。我们现在所说的容器存放的东西可能更偏向于应用比如网站、程序甚至是系统环境。 虚拟化技术和容器化技术 虚拟化技术 首先，Doc ...

NOTE_JS 介绍 ✨ 尚硅谷最新版JavaScript基础全套教程完整版 140集实战教学 JS从入门到精通 实战 ✅ 图片切换 ✅ 全选练习 ✅ 添加删除记录 ✅ 协议注册 ✅ 拖拽 ✅ 定时图片切换 ✅ div移动优化 ✅ 轮播图 ✅ 二级菜单 整理难免有误，欢迎大家批评指正！ JS简介 1、什么是语言 计算机就是一个由人来控制的机器，人让它干嘛，它就得干嘛。 我们要学习的语言就是人和计算机交流的工具，人类通过语言来控制、操作计算机。 编程语言和我们说的中文、英文本质上没有区别，只是语法比较特殊。 语言的发展： 纸带机：机器语言 汇编语言：符号语言 现代语言：高级语言 2、JS起源 JavaScript诞生于1995年，它的出现主要是用于处理网页中的前端验证。 所谓的前端验证，就是指检查用户输入的内容是否符合一定的规则。 比如：用户名的长度，密码的长度，邮箱的格式等。 3、JS简史 JavaScript是由网景公司发明，起初命名为LiveScript，后来由于SUN公司的介入更名为了JavaScript。 1996年微软公司在其最新的IE3 ...

NOTE_HTML5 介绍 ✨尚硅谷Web前端HTML5 CSS3初学者零基础入门全套完整版学习笔记 软件 ✨视频中使用到的软件和资源，还有一些其他的开发工具，仅供参考（eg. 考虑到部分下载速度的问题，特意整理了部分软件到Software仓库下，大家可以自取） Zeal 离线文档：Zeal - Offline Documentation Browser NotePad 官方地址：notepad-plus-plus.org Softonic地址：Notepad++ - Download (softonic.com) Sublime 官方地址：Sublime Text - A sophisticated text editor for code, markup and prose VS Code 官方地址：Visual Studio Code - Code Editing. Redefined 安装的插件 Chinese (Simplified) Language Pack for Visual Studio Code Ayu vscode-ic ...

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介绍 在本文中，将了解 Python 类型检查 (Type-Checking) 。 在本教程中，将了解以下内容： 类型注释和类型提示 将静态类型添加到代码中，包括你的代码和其他人的代码 运行静态类型检查器 在运行时强制类型 类型系统 所有编程语言都包含某种类型系统，该系统形式化了它可以使用哪些类别的对象以及如何处理这些类别。 例如，一个类型系统可以定义一个数字类型，42作为一个数字类型对象的例子。 动态类型 (Dynamic Typing) Python 是一种动态类型语言。这意味着 Python 解释器仅在代码运行时进行类型检查，并且允许变量的类型在其生命周期内更改。以下虚拟示例演示 Python 具有动态类型： 123456789>>> if False:... 1 + "two" # This line never runs, so no TypeError is raised... else:... 1 + 2...3>>> 1 + "two" # Now this is type checke ...

介绍 Python 是一种动态类型语言。它在运行时而不是编译时确定数据类型。Python 类型的一些示例包括整数、浮点数、字符串和布尔值。动态类型语言与静态类型语言（如 C++、Java 和 Fortran）形成对比，后者在编译时执行类型检查。 动态类型语言（如 Python）的一个优点是程序员不需要为每个声明的变量指定类型。相反，Python 解释器在运行时推断并分配一个类型。与使用静态类型语言（如 Java）相比，这导致更简洁的代码可以更快地编写。 这种简洁的风格也有其缺点。因为解释器更努力地填充 Python 留下的隐含内容，所以 Python 程序可能需要更长的时间来执行。你也可能偶尔会遇到错误，因为 Python 错误地解释了变量的类型。代码完成工具也可以更好地工作，并且对于静态类型的语言功能更全面。 最近对 Python 的增强使静态类型成为一种选择。替代语法现在让程序员可以选择以静态类型的方式编写他们的 Python 代码。Mypy是一个用于帮助您使用类型注释编写或重写 Python 代码的工具。这个工具为你的 Python 程序带来了静态类型的好处。 什么是Mypy？ ...

简介 当您的 Python 项目依赖于外部包时，您需要确保使用每个包的正确版本。更新后，软件包可能无法像更新前那样工作。 Python Poetry 这样的依赖管理器可帮助在项目中指定、安装和解析外部包。这样，可以确保始终在每台机器上使用正确的依赖版本。 在本文中，将介绍： 开始一个新的Poetry 项目 将Poetry 添加到现有项目 使用pyproject.toml文件 引脚依赖项 安装依赖项poetry.lock 执行基本的 Poetry CLI命令 使用Poetry将帮助启动新项目、维护现有项目并掌握依赖管理。您将准备好使用pyproject.toml文件，这将是在 Python 项目中定义构建要求的标准。 虽然本教程侧重于依赖管理，但 Poetry 还可以帮助您构建和打包项目。如果您想分享您的作品，您甚至可以将您的 Poetry 项目发布到Python Packaging Index (PyPI)。 写在前面 在深入了解 Python Poetry 的本质之前，需要了解一些先决条件。 相关术语 如果在其中一个Python脚本中使用了import 语 ...

从 Python 3.6 开始，f-strings 是一种很好的格式化字符串的新方法。它们不仅比其他格式化方式更易读、更简洁、更不容易出错，而且速度也更快！ 在本文结束时，您将了解如何以及为什么从今天开始使用 f-string。 Python 中的“老派”字符串格式 在 Python 3.6 之前，有两种主要方法可以将 Python 表达式嵌入到字符串文字中以进行格式化：%-formatting 和str.format(). 您将看到如何使用它们以及它们的局限性。 1: %-formatting 这是 Python 格式化的 OG，从一开始就在该语言中。 您可以在 Python 文档中阅读更多内容。请记住，文档不建议使用 %-formatting，其中包含以下注释： 这里描述的格式化操作表现出各种quirks，这些quirks会导致一些常见错误（例如无法正确显示元组和字典） 使用较新的格式化字符串文字或 str.format() 接口有助于避免这些错误。 这些替代方案还为格式化文本提供了更强大、更灵活和可扩展的方法。 格式化符号 功能 %s 格 ...